商品有机肥生产的主要物料包括畜禽粪便、城市污泥、生活垃圾、糠壳饼麸、作物秸秆、制糖和造纸滤泥、食品和发酵工业下脚料以及其他城乡有机固体废物。从物料来源来说，取材范围还是相当广泛的，但是所含成分也是极其复杂的。

　　不过无论对于任何原料来说，要制成商品有机肥，其生产工艺不外乎两部分，一是有机物料的堆沤发酵和腐熟过程，其作用是杀灭病原微生物和寄生虫卵，进行无害化处理；二是腐熟物料的造粒生产过程，其作用是使有机肥具有良好的商品性状、稳定的养分含量和肥效，便于运输、贮存、销售和施用。

　　发酵和制粒作为生产中的主要步骤，所用的机械设备理所当然地成为一条有机肥生产线中的核心设备。发酵一般情况下采用槽式发酵，这样的话成本较低而且发酵效率相对较高，设备选用上可以用普通槽式翻堆机，也可以用双螺旋翻堆机或链板式翻堆机，这个根据场地情况及成本控制。造粒选用设备时，纯有机肥造粒使用搅齿造粒机，复混肥的话有专门的复混肥造粒机，它是搅齿造粒机的升级版，在生产复混肥时具有一定优势。